Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms