Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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