Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2O35245 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms