Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ArxO35085 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ArxO35085 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ArxO35085 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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