Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CckarO08786 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CckarO08786 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckarO08786 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckarO08786 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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