Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms