Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms