Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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