Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm11236J3QMS7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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