Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c3J3QJW5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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