Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms