Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms