Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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