Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M1F7CXU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms