Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Urb2E9Q7L1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Urb2E9Q7L1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms