Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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