Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pgbd1E9Q492 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pgbd1E9Q492 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pgbd1E9Q492 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms