Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fndc1E9Q043 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc1E9Q043 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms