Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms