Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprbB2RU80 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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