Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms