Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zbed5B2RPU8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbed5B2RPU8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms