Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms