Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SetxA2AKX3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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