Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms