Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calcoco2A2A6M5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms