Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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