Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd1Q9Z2E2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms