Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek4Q9Z1J2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms