Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms