Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CcsQ9WU84 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms