Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psma1Q9R1P4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms