Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms