Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod3Q9R0E1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms