Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms