Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnt3Q9QZ47 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms