Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms