Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms