Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolkQ9QUG2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms