Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms