Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Reep6Q9JM62 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Reep6Q9JM62 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms