Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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