Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms