Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms