Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Tmod3Q9JHJ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod3Q9JHJ0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms