Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cldn12Q9ET43 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms