Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl4Q9DCU6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms