Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rrp8Q9DB85 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rrp8Q9DB85 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rrp8Q9DB85 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rrp8Q9DB85 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp8Q9DB85 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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