Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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