Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms